Набор для мультиплексного секвенирования ДНК с баркодированием образцов методом ПЦР, PCR Barcoding Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-PBK004
Предлагаем к покупке Набор для мультиплексного секвенирования ДНК с баркодированием образцов методом ПЦР, PCR Barcoding Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-PBK004. На рынке медицинского оборудования компания ЛидерМед Групп уже более 10 лет! С нами сотрудничают как крупные государственные учреждения, так и частные международные клиники. Среди наших поставщиков ведущие производители медоборудования с многолетней историей, опытом и надежной репутацией. Вся продукция лицензирована и сертифицирована в соответствии с установленными требованиями.
Мультиплексное секвенирование с баркодированием удобно, если количество сиквенсных данных, получаемое с одного образца, существенно меньше производительности проточной ячейки. В таком случае имеет смысл объединять образцы в одну библиотеку и секвенировать их одновременно. Это также снижает стоимость секвенирования каждого образца.
НаборPCR Barcoding Kitудобен в тех случаях, когда:
- возможно объединение до 12 образцов в общую библиотеку с целью снижения стоимости запуска секвенатора;
- исходное количество ДНК невелико;
- предполагается оптимизировать эксперимент с целью макисмального выхода;
- требуется контроль длины рида;
- секвенируется кДНК или специфические ампликоны.
Особенности набора:
время пробоподготовки | от 60 минут (без учёта стадии ПЦР) |
требуемое количество ДНК | менее 100 нг двухцепочечной ДНК |
необходимость ПЦР | да |
фрагментация ДНК | опциональная |
длина рида | равна длине ампликонов |
производительность | 2 гигабазы и более за 6 часов, 8 гигабаз и более за 48 часов |
совместимые протоколы | PCR Barcoding Nested PCR Sequencing cDNA PCR Barcoding * |
количество библиотек | 6 библиотек до 12 образцов в каждой |
* Полные протоколы доступны на сайтеwww.nanoporetech.comдля зарегистрированных пользователей-участниковNanopore Community.
НаборPCR Barcoding Kitтакже может быть использован в сочетании с наборомPCR cDNA Sequencing Kit(SQK-PCS109) для мультиплексного секвенирования кДНК.
Пробоподготовка заключается в опциональной фрагментации геномной ДНК с последующей достройкой концов, лигировании адаптеров к достроенным концам и ПЦР с праймерами, содержащими бар-коды. В состав набора входит 12 пар бар-кодированных праймеров. В конечном итоге образцы после ПЦР объединяются, и к смеси добавляются сиквенсные адаптеры.
Длины фрагментов, получаемых в ходе ПЦР, зависят от длины исходной матрицы и от процессивности ДНК-полимеразы. Максимальная длина рида составляет в среднем около 2 тыс п.н.
Пользователь также может использовать метод ПЦР с 2 парами праймеров (nested PCR); при этом одна пара праймеров - пользовательские праймеры к определённой последовательности ДНК, а вторая - бар-кодированные праймеры из набора. 5’-концы пользовательских праймеров должны быть комплементарны 3’-концам бар-кодированных праймеров.
Последовательности бар-кодов автоматически распознаются программой для интерпретации данных секвенирования, и риды группируются в соответствии с бар-кодами.
Ещё одно преимущество набора — если исходная ДНК загрязнена, то в ходе ПЦР существенно снижается концентрация примесей, которые могут ингибировать процесс получения библиотеки.
Если количество исходной ДНК менее 1 нг — рекомендуется предварительная полногеномная амплификация.
Дополнительные расходные материалы и реактивы:- магнитные частицыAgencourt AMPure XP(Beckman Coulter);
- набор для достройки концов ДНКNEBNext End repair/dA-tailing Module(New England Biolabs E7546);
- набор для лигирования ДНКNEB Blunt/TA Ligase Master Mix(New England Biolabs M0367);
- мастер-микс для ПЦР длинных фрагментов, например,LongAmp Taq 2X Master Mix(New England Biolabs M0287);
- 1,5 мл пробирки типа Эппендорф с низкой адгезивностьюDNA LoBind(Eppendorf30108051);
- 0,2 мл тонкостенные пробирки для ПЦР (AxygenPCR-02-C);
- вода, не содержащая нуклеаз (Thermo Fisher ScientificR0581);
- свежеприготовленный 70% этанол;
- буфер 10 мМ Трис-HCl с 50 мМ NaCl.
Опционально:
- пробирки для фрагментации ДНКCovaris g-TUBE.
Дополнительное оборудование:
- настольная микроцентрифуга (например,Eppendorf#5452000018);
- вортекс (например,BiosanBS-010203-AAG);
- магнитный штатив (Диаэм3336);
- ротационный перемешиватель (например,ElmiRM1L);
- амплификатор (например,Thermo FSA37834);
- набор автоматических пипеток переменного объёма — от 0,5 до 10 мкл (например,Eppendorf3120000020), от 2 до 20 мкл (например,Eppendorf3120000038), от 10 до 100 мкл (например,Eppendorf3120000046), от 20 до 200 мкл (например,Eppendorf3120000054) и от 100 до 1000 мкл (например,Eppendorf3120000062);
- наконечники с фильтром к автоматическим пипеткам;
- термоконтейнер со льдом;
- таймер (например, TR118OS).
- флуориметрQubit 4.0(ThermoQ33227);
- система для фрагментного анализа (например,Qsep 100);
- наноспектрофотометр (например, NanoDrop 2000C).
Вы можете купить Набор для мультиплексного секвенирования ДНК с баркодированием образцов методом ПЦР, PCR Barcoding Kit, Oxford Nanopore Technologies, SQK-PBK004 уже сегодня, связавшись с персональным менеджером по указанному номеру телефона или через почту. Вас обязательно проконсультируют по любым выбранным товарным позициям и помогут подобрать оптимальный вариант. Также рады сообщить, что доставка осуществляется по территории всей России и ближнего зарубежья. При необходимости опционально доступна поставка и установка дополнительного оборудования. После покупки предоставляется сервисное и гарантийное обслуживания.
Гарантия
По вопросам гарантии и сервиса обращайтесь по адресу lider@biomedgroup.ru. Подробная информация на странице Гарантия.
Доставка
По вопросам, связанным с оплаченными счетами на отгрузку и доставку продукции в Днепре, РФ и СНГ, звоните по общему телефону или пишите в отдел сопровождения заказов: lider@biomedgroup.ru. Подробная информация на странице Доставка.
В нашем интернет-магазине медицинского оборудования актуальны два популярных вида оплаты:
- 100 % наличными,
- 100 % безналичным перечислением на наш счет.
Ознакомьтесь, пожалуйста, с их условиями и особенностями!
Оплата наличными
Рассчитаться «кешем» в «ЛидерМед Групп» очень просто: передайте нужную сумму курьеру, доставившему товар, или заплатите за него наличными в кассу нашего склада, если покупка доставляется самовывозом.
ВНИМАНИЕ! Опция «Оплата наличными» за товары, доставленные курьером на адрес покупателя, доступна только физическим лицам.
Безналичные перечисления
Быстрый и безопасный способ, минимизирующий физические контакты и риск воздушно-капельной инфекции, что особенно важно после актуализации проблемы мировой эпидемии.
Безналичный расчет — это банковская операция по электронному перечислению суммы, эквивалентной стоимости товара. Выполняется со счета покупателя на счет продавца — «ЛидерМед Групп».
Особые преимущества для наших покупателей
Общее правило оплаты товаров «ЛидерМед Групп» — полная предоплата.
Для наших клиентов, которые по каким-либо причинам испытывают трудности со 100%-м расчетом, предлагаем отсрочку платежа. В зависимости от ситуации персонально предоставляем отсрочку на срок:
- от 5 дней,
- до 60 дней.
Общая стоимость приобретаемого изделия не имеет значения.
Особенности предоплаты при предоставлении отсрочки
Единственное условие — внести на наш счет частичную оплату за заказанный товар. Обычно предоплата составляет 30 % от всей суммы. Оставшиеся 70 % покупатель вносит по факту поставки продукции.